أمانة مجلس الجامعة هي إدارة تنفيذية تقوم بتسهيل مهام مجلس الجامعة وتقديم كافة خدمات الإدارة وأعمال السكرتارية لكل ما يتعلق بأعمال المجلس وبما يتوافق مع نظام المجلس ومع كافة التعليمات التي تصدر من الإدارة العليا، و ترتبط الأمانة بأمين مجلس الجامعة .