مع انطلاقة الجامعة في عام 1431 هـ ، بدأت وكالة الجامعة للدراسات العليا والبحث العلمي نشاطها ومهامها العلمية والبحثية، وصاغت رسالتها بكل دقة في السعي نحو:
- توفير البيئة المحفزة للإنتاج العلمي لكافة منسوبي الجامعة.
- نشر ثقافة البحث العلمي وتأصيل قضاياه داخل وخارج الوسط الأكاديمي والعمل على استقطاب كفاءات وطنية مخلصة تساهم في تنمية المجتمع.
- الشراكة المجتمعية مع كافة قطاعات المجتمع.